Fraunhofer-Institut für Grenzflächen- und Bioverfahrenstechnik IGBVisualisierung mit dem GeneScapes Viewer
Die Interpretation von Sequenzdaten wird durch eine übersichtliche visuelle Darstellung wesentlich erleichtert. Daher wurde am Fraunhofer IGB der GeneScapes Viewer entwickelt, gleichsam ein Genom-Browser, der eine interaktive und leicht anpassbare Betrachtung verschiedener Datensätze erlaubt. So können wir unter anderem Expressionsdaten mit unterschiedlichen Auflösungen entweder auf ganzen Genomabschnitten oder, in höherer Detailtiefe, auf Sequenzniveau analysieren.
Zusätzlich bietet GeneScapes Viewer weitere Funktionen, beispielsweise zur manuellen Re-Annotierung von transkriptionell aktiven Regionen mittels eines intuitiven Annotate-by-Click-Prinzips, welches die Erstellung neuer Genmodelle erleichtert. Andere Funktionalitäten wie beispielsweise Wiggle-Plots erlauben darüber hinaus eine rasche Übersicht über die Expressionsstärke von Genen unter verschiedenen Bedingungen.