Funktionelle Genomanalysen mittels Next-Generation Sequencing (NGS)

Next-Generation Sequencing (NGS) bezeichnet eine neuartige Technologie der Nukleinsäureanalytik. Im Gegensatz zu bisher bekannten Sequenzierungsverfahren können simultan mehrere hundert Millionen Fragmente in einer Probe sequenziert werden. Diese Hochdurchsatz- oder Parallelsequenzierungstechnologien haben gänzlich neue Dimensionen in der Nukleinsäureanalytik eröffnet und unzählige Forschungsfelder im Bereich der Life Sciences revolutioniert.

In unserer Arbeitsgruppe Functional Genomics nutzen wir die NGS-Technologie für ein breites Spektrum an Fragestellungen im wissenschaftlichen wie auch im anwendungsorientierten Bereich. Projekte umfassen beispielsweise die De-novo-Sequenzierung industriell oder medizinisch interessanter Bakterien- und Pilzstämme, Analysen der Transkriptionsprofile, die Identifizierung relevanter Gene beispielsweise für die Früherkennung von Tumorerkrankungen und das Screening nach Biomarkern für die Diagnostik.

Besonders stolz sind wir darauf, in unserer Gruppe den kompletten Arbeitsablauf von der Probenvorbereitung über die Sequenzierung bis hin zur bioinformatischen Auswertung anbieten zu können.

Am Fraunhofer IGB haben wir einen dreistufigen Arbeitsprozess etabliert, der die Schritte der Probenaufbereitung und der Sequenzierung im Labor wie auch die abschließende, bioinformatische Analyse abdeckt.

Unser Institut kann so den kompletten Arbeitsablauf als One-Stop-Shop anbieten. Wir helfen Ihnen gern kurzfristig bei einer spezifischen Fragestellung oder stehen als verlässlicher Partner für ein langfristiges Projekt an Ihrer Seite.

Dank der Kombination unserer State-of-the-Art-Ausstattung (Illumina NextSeq2000, Illumina MiniSeq, Oxford Nanopore MinION, QIAcube, Biomek FX etc.) mit unserer langjährigen Erfahrung im NGS-Bereich können wir Ihnen eine Vielfalt an Protokollen und Analysen anbieten, die Sie der Lösung Ihrer Fragestellung näher bringt.